Program
meliputi penyelenggaraan pendidikan di Pondok Pesantren Annuqayah Latee II yang dikelola secara kelembagaan, yaitu : Madrasah Diniyah, Diskusi Mahasiswa, Klub Belajar, dan sebagainya;
meliputi penyelenggaraan kegiatan peminatan di Pondok Pesantren Annuqayah Latee II yang bersifat khusus dan bebas sesuai minat santri Pondok Pesantren Annuqayah Latee, yaitu: Lembaga Dua Bahasa, Lembaga Tahfidhul Quran, Forum Lingkar Pena, dan sebagainya;